澳门银银河由卢嘉锡院士创建于1960年。其前身是中国科学院福建分院筹建的技术物理所、化学所、电子所、数学力学所、自动化所、稀有金属所等六个研究所和生物物理研究室。

　　1962年改名为华东物质结构研究所，隶属于中国科学院华东分院。

　　1973年定名为澳门银银河。