研究方向:
结构生物学研究:以生物物理化学技术,包括X射线结晶学和生物信息学为主要手段,研究解决生物学中提出的重要结构问题,总结大分子结构和功能的相关性,为包括多肽和蛋白质在内的大分子的研究、设计和功能改进提供结构基础,并最终达到理性设计创新药物的目的。我们的研究集中在血液纤溶蛋白、丝氨酸水解酶、细胞表面受体等方面。具体的实验工作将涵括基因克隆,蛋白质表达、纯化与结晶,晶体结构解析与修正等等。
化学生物学研究,包括了光动力学抗肿瘤和抗菌研究,以及基于蛋白的小分子抑制剂研究:光动力学方法利用光敏剂来敏化可见光,产生光毒性、达到杀灭肿瘤的目的。该方法没有耐药性、毒副作用小,是近些年来新兴的、已被美国食品药品监督管理局批准的抗肿瘤疗法。我们发展了有特色的光敏剂、合成和一系列的靶向性的光敏剂、开展起抗肿瘤或抗菌研究,已经积累较多的研究成果。另外,我们还开展尿激酶、PAI-1等蛋白的小分子抑制剂的开发研究工作,并取得显著的成果。
主要科研成果:
黄明东博士在包括《科学》和《自然》类等杂志上发表了八十几篇文章。其中一项成果是尿激酶-尿激酶受体复合物的晶体结构,许多研究报告指出了尿激酶和尿激酶受体在癌症扩散和转移中起了重要作用,阻断尿激酶-尿激酶受体的相互作用被认为是抑制肿瘤转移的重要途径之一,本课题组经过多年的努力测定了一系列尿激酶受体和尿激酶复合物的晶体结构,这些结果对研究尿激酶与受体的相互作用、及设计尿激酶受体抑制剂有重大的指导作用。在光动力学研究方面,我们发明了基于细胞动态分析仪的光动力学检测方法,另外,今年完成了受体靶向性酞菁光敏剂的研究工作,发表在PLOS ONE杂志上(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3365043/)。
本课题组的研究成果被邀请在多个单位和国际会议上做报告,包括了Plasminogen Activation & Extracellular Proteolysis的Gordon Research Conference等。2011年我组林忠辉博士荣获ISTH国际会议颁发的《第三世界科学家奖》,全国仅有两人获此殊荣。本课题组与丹麦相关的6个课题组成立了中丹第一个双边合作研究中心(中丹肿瘤和水解酶研究中心,http://www.proteasesandcancer.org/),进行了实质性的合作研究,至今已开了九次的双边国际研讨会(http://www.proteasesandcancer.org/events.html),该中心也积极开展了双边人才交流和青年人才培养,丹麦方面有一位博士到我组开展博士后工作。
研究特色:
1)学科交叉的研究工作,包括了结构生物学、化学生物学和光动力学。有助于学生获得多方面、多学科的训练。
2)广泛的国际合作,和丹麦、香港、法国、美国的科学家建立了实质性的合作研究关系。
3)在结构生物学研究方面,我们采用了真核蛋白体系(果蝇S2细胞等),表达了许多与人类疾病密切相关的重组蛋白质,用于结构生物学研究。
部分文章目录:
1.Huang M, Weissman, JT, Wang C, Chen W, Wilson IA, Balch WE (2001). Crystal Structure of Sar1-GDP at 1.7? Resolution and the Role of the N-terminus in ER Export. J. Cell Biology, 155(6):937.
2.Huang M, Rigby AC, Morelli X, Grant MA, Huang G, Furie B, Seaton B & Furie BC (2003). Structural basis of membrane binding by Gla domains of vitamin K–dependent proteins. Nature Structural Biology, 10(9):751-6.
3.Huai Q, Mazar AP, Kuo A, Parry GC, Shaw DE, Callahan J, Li L, Yuan C, Bian C, Chen C, Furie B, Furie BC, Cines DB, Huang M (2006) Structure of Human Urokinase Plasminogen Activator in Complex with its Receptor, Science, 311(5761):656-9.
4.Yang F, Bian C, Zhu L, Zhao G, Huang Z, Huang M (2007) Effect of Human Serum Albumin on Drug Metabolism: Structural Evidence of Esterase Activity of Human Serum Albumin, J. Structural Biology, Feb;157(2):348-355
5.Zhao G, Yuan C, Wind T, Huang Z, Andreasen PA, Huang M (2007) Structural basis of specificity of a peptidyl urokinase inhibitor, upain-1. J Struct Biol. 49(1):71-7.
6.Yuan C and Huang M (2007) Does uPAR exist in a latent form? Cell. Mol. Life Sci., 64(9):1033-7.
7. Huai Q, Zhou A, Lin L, Mazar AP, Parry GC, Callahan J, Shaw DE, Furie B, Furie BC, Huang M (2008) Crystal structures of two human vitronectin, urokinase and urokinase receptor complexes. Nat Struct Mol Biol. 15(4):422-3.
8. Guo, SH, Shi, X.L., Yang, F., Chen, L.Q., Meehan, E.J., Bian, C.B. & Huang, M.D. (2009). Structural basis of transport of lysophospholipids by human serum albumin. Biochemical Journal, 423:23-30.
9.Chen Z, Zhou S, Chen J, Deng Y, Luo Z, Chen H, Hamblin MR, Huang M (2010) Pentalysine β-carbonyl phthalocyanine zinc: An Effective Tumor-targeting Photosensitizer for Photodynamic Therapy, ChemMedChem, 7; 5(6):890-8.
10. Ngo JC, Jiang L, Lin Z, Yuan C, Chen Z, Zhang X, Yu H, Wang J, Lin L, Huang M.(2011) Structural Basis for Therapeutic Intervention of uPA/uPAR System. Curr Drug Targets. 12(12):1729-43.
11. Xu P, Chen J, Chen Z, Zhou S, Hu P, Chen X, Huang M (2012), Receptor-targeting Phthalocyanine Photosensitizer for Improving Antitumor Photocytotoxicity, PLOS One, 7(5): e37051